歐洲區
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主条目：2006年國際足協世界盃外圍賽 (歐洲區)
每組的首名直接晉身2006年世界盃決賽周，而在八組中兩隊成績最佳的第二名都會晉身2006年世界盃決賽周。其餘六組的第二名進行雙循環的附加賽，最終勝出的三隊可晉身決賽周。
粗體字代表出線外圍賽
斜體字代表進入附加賽階段
斜體粗字及代表經附加賽出線的球隊
第一組
第二組
第三組
第四組
1. 荷蘭
1. 乌克兰
1. 葡萄牙
1. 法國
2. 捷克
2. 土耳其
2. 斯洛伐克
2. 瑞士
3. 羅馬尼亞
3. 丹麦
3. 俄羅斯
3. 以色列
4. 芬兰
4. 希腊
4. 爱沙尼亚
4. 爱尔兰
5. 北馬其頓
5. 阿尔巴尼亚
5. 拉脫維亞
5. 賽普勒斯
6. 亞美尼亞
6. 格鲁吉亚
6. 列支敦斯登
6. 法罗群岛
7. 安道尔
7. 哈萨克斯坦
7. 盧森堡
第五組
第六組
第七組
第八組
1. 義大利
1. 英格兰
1. 塞爾維亞與蒙特內哥羅
1. 克罗地亚
2. 挪威
2. 波蘭
2. 西班牙
2. 瑞典
3. 苏格兰
3. 奥地利
3. 波黑
3. 保加利亚
4. 斯洛維尼亞
4. 北爱尔兰
4. 比利时
4. 匈牙利
5. 白俄羅斯
5. 威尔士
5. 立陶宛
5. 冰島
6. 摩尔多瓦
6. 阿塞拜疆
6. 圣马力诺
6. 馬爾他
歐洲區外圍賽各分組成績及賽程資料可參見2006年世界盃-歐洲區外圍賽。
南美洲區
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主条目：2006年國際足協世界盃外圍賽 (南美洲區)
南美州區的世界盃外圍賽是於2003年9月開始，外圍賽是以全部十隊進行雙循環的對賽（主場和作客）。18 場結束後，首 4 名隊伍可直接晉身2006年世界盃決賽週，而第 5 名的國家隊要和大洋州區的優勝者進行兩回合的附加賽，最後的勝利者進入 32 強決賽。
2005年6月8日，阿根廷 3–1 擊敗巴西後已經肯定2006年世界盃決賽周。另外，巴西於9月4日以 5–0 戰勝智利後已肯定成功晉身決賽周，而厄瓜多爾及巴拉圭均在最後一場才確定出線。
非洲區
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主条目：2006年國際足協世界盃外圍賽 (非洲區)
非洲區共有5個名額：出線球隊有
多哥:10月8日以3-2反勝剛果，小組領先塞內加爾2分而出線
加納:10月8日3-0取勝對手，另一方面南非只同剛果民主共和國打成2-2，令加納壓倒對方出線
象牙海岸:10月8日因為喀麥隆與埃及打成1-1，令3-0擊敗對手的象牙海岸得以以一分優勢力壓喀麥隆出線
安哥拉:10月8日安哥拉及奈及利亞各自擊敗對手，但兩隊的對賽成績中安哥拉比較好而出線
突尼西亞:10月8日突尼西亞成功主場迫和小組次名摩洛哥，1分壓倒對方出線
粗體字代表出線外圍賽
第一組
第二組
第三組
第四組
第五組
1. 多哥
1. 迦納
1. 象牙海岸
1. 安哥拉
1. 突尼西亞
2. 塞內加爾
2. 剛果民主共和國
2. 喀麥隆
2. 奈及利亞
2. 摩洛哥
3. 尚比亞
3. 南非
3. 埃及
3. 辛巴威
3. 幾內亞
4. 剛果共和國
4. 布吉納法索
4. 利比亞
4. 加蓬
4. 肯雅
5. 馬利
5. 佛得角
5. 蘇丹
5. 阿爾及利亞
5. 博茨瓦納
6. 賴比瑞亞
6. 烏干達
6. 貝南
6. 盧旺達
6. 馬拉威
非洲區外圍賽第一圈成績及各分組賽成績和賽程可參見2006年世界盃-非洲區外圍賽。
大洋洲區
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主条目：2006年國際足協世界盃外圍賽 (大洋洲區)
大洋洲區有0.5個名額，須與南美洲區第五名代表爭奪一個決賽周席位
澳洲成為大洋洲區的代表須與南美洲區第五名代表爭取出線。
2005年9月3日， 澳洲於大洋洲區決賽首回合以7-0大勝 所羅門群島其後於9月6日以2-1再次擊敗對方而成為大洋洲區代表。
大洋洲區外圍賽第一圈分組賽成績可參見2006年世界盃-大洋洲區外圍賽
亞洲區
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主条目：2006年國際足協世界盃外圍賽 (亞洲區)
粗體字代表出線決賽周
斜體字代表出線附加賽階段
A組
B組
1.
沙烏地阿拉伯
1.
日本
2.
南韓
2.
伊朗
3.
烏茲別克
3.
巴林
4.
科威特
4.
北韓
亞洲區外圍賽首圈及次圈詳細比數以及各分組賽成績可參見2006年世界盃-亞洲區外圍賽。2005年8月18日，沙烏地阿拉伯、日本、南韓以及伊朗都已正式晉身2006年世界盃的決賽周，而A、B組的第三名的烏茲別克及巴林需進行附加賽，勝出的隊伍可以與中，北美洲及加勒比海區的小組第四名爭取出線席位。
中北美洲及加勒比海區
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主条目：2006年國際足協世界盃外圍賽 (中北美洲及加勒比海區)
粗體字代表出線外圍賽
斜體字代表晉級附加賽階段
決賽圈
1. 美國
2. 墨西哥
3. 哥斯達黎加
4. 千里達及托巴哥
5. 危地馬拉
6. 巴拿馬
中，北美洲及加勒比海區外圍賽所有賽事比數及各組成績（包括預賽、第一圈、第二圈和第三圈）可參見2006年世界盃足球賽外圍賽-中北美洲及加勒比海區。
附加賽
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在2005年11月12日和16日，共進行餘下五場附加賽，包括：
南美洲區小組第五名對大洋洲區冠軍，由澳洲勝出；
亞洲區第二圈外圍賽A、B組的第三名的勝方（即第五名）對中北美洲及加勒比海區小組第四名，由千里達及托巴哥勝出；
三場歐洲區小組次名附加賽，勝出隊伍為捷克、西班牙及瑞士。
附加賽以雙循環進行，設立作客入球優惠，如兩回合打成平手，則進入加時階段，未能分出勝負的話，最後以十二碼決定勝方。所有勝方最終晉身2006年世界盃的決賽周。